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好玩的matlab
! ?) w# Q4 B; \; k" c$ W, W带你解锁不一样的matlab新玩法
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相信大家都绘制过柱状图,可是大家绘制的柱状图真的好看嘛~现在来看看SCI论文里面的柱状图是什么样的。以下是来自science2020[1]论文里的配图,接下来手把手带大家用MATLAB来复现一下这两个柱状图。5 W/ a7 U& A' B; T
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效果 b* x* O( ]( \, n; L o
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左边是复现的图,右边是原图。虽然不是一模一样,但大部分元素还是复现出来了。# f8 F0 k4 B Q5 `& |
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绘制要素% B b7 W. V* j7 ~" b+ n5 ]
, x- A' S& H% |" G# u第一个绘图要素:颜色
0 X3 C) n& K& v0 J3 G" I4 L看到这张图,首先映入眼帘的是啥呢?当然是颜色了!颜色配的好,作图就成功了一大半。首先要获得图片里的颜色~第二个绘图要素:数据
3 \# q, C) ?7 x' ]. L作图数据是必不可少的,但你要画图的画,你肯定已经有数据了。当然小编没有这篇SCI论文里的数据,所以就仿造了一点数据。) ~4 v/ x5 H: O
第三个绘图要素:框架
9 I: J* e) V( y2 ^4 S* X! \9 D3 P 所谓画图的框架,也可以称为画图的函数吧,明显可以看出这不是 一张简单的柱状图,它还叠加了误差图,散点图,需要用到三个 MATLAB里面的绘图函数,bar,errorbar,scatter。知道了这三个要素咱 就可以开始画了。
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1、取色
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还是使用和【图片配色】那篇推送一样的方法,还没有看过的可以去看一眼,要想复现出一样的图,肯定先得拿出这张图的颜色。2 V& x* [1 c, x }0 e
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: |* L7 q5 E+ _* Y! ], S1 l那么问题来了,这张图有几种颜色呢?
4 X( O0 [$ l8 o- d4 P当然是7种颜色了,注意散点图和柱状图边缘颜色是不一样的奥。用以下代码取色图片就是上面的截图,运行之后在图片不同颜色点处打点,完了之后按enter,颜色就自动取出来了。0 O* o0 _" r9 I8 w( X
% 公众号:好玩的MATLABhua=imread('1.png');figure(1)imshow(hua);[c1,c2]=getpts; %选择颜色点c1=ceil(c1); %将选点的位置化为整数c2=ceil(c2);for i=1:length(c1) color(i,:)=hua(c2(i),c1(i),:);endcolor=double(color);color=color/255;+ i7 H& J- d' l6 p9 `6 f$ x$ k
以下就是取出的七种颜色了,建议把它记录下来,省得下一次麻烦。记录下来的颜色变量如下8 U$ O. D$ L5 i2 b; [& ~* E6 e, Y
color=[0.717647058823529,0.682352941176471,0.741176470588235;... 0.807843137254902,0.792156862745098,0.890196078431373;0.580392156862745,... 0.525490196078431,0.729411764705882;0.392156862745098,0.345098039215686,... 0.470588235294118;0.560784313725490,0.533333333333333,0.741176470588235;... 0.372549019607843,0.282352941176471,0.600000000000000;0.0156862745098039,... 0.0196078431372549,0.0156862745098039]; {1 i/ H) e; `+ p' z% D
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这张看起来小小的柱状图,包含的数据信息还真不少呢。以下是根据原图自拟的数据,凑合着用。8 O+ \ V+ Z# U( l3 D' G0 X @4 j
% 公众号:好玩的MATLABy=[28,34,18];%柱状图纵坐标x=[1,2,3]; %柱状图横坐标%散点图的横纵坐标s1{1,1}=[0.9,0.95,0.95,1,1,1.05,1.1,1.1];s1{1,2}=[1.85,1.9,1.95,2,2,2,2,2.2];s1{1,3}=[2.7,2.7,2.95,3,3,3,3,3,3.2,3.2,3.2];s1{2,1}=[18,24,36,30,42,20,29,38];s1{2,2}=[26,22,24,30,38,42,48,50];s1{2,3}=[9,19,8,12,18,24,30,40,10,17,19];low=[4,3,3]; %误差图的上限high=[3,2,1]; %误差图的下限
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3、画图
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_# h( Z' T2 g7 ^" ]1 初始化显示位置
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看起来不起眼的一点实则非常重要,可以根据论文的大小来设置图片的大小,很大程度上可避免后期拖拉图片造成的字体变形,不清晰等问题。
% S$ [/ W/ E: d2 `4 @" V%%初始化显示位置 [x,y,dx,dy] 从 x,y坐标开始,dx,dy为沿升的长度figure('Units', 'pixels', ... 'Position', [100 100 360 375]);) w, {2 B& H, a% }- p) I
2 循环画图和配色) k) }& I' W2 J: U
( e! Q4 `' \# V. w' q 设置柱状图的宽度让柱状图间隔大一点,注意柱状图的填充颜色和边缘颜色是需要区分开来的。其他改变画图的标记都在下面了~。8 Q; z& a5 M1 ?! T4 u
width=0.6; %柱状图宽度for i=1:length(y) %bar(i,y(i),width) width 柱状图宽占比 ,FaceColor 柱状图填充颜色 ,EdgeColor 柱状图边缘颜色 % LineWidth 边缘线宽 set(bar(i,y(i),width),'FaceColor',color(i,:),'EdgeColor',color(i+3,:),'LineWidth',2) hold on %散点图 大小,填充颜色 scatter(s1{1,i},s1{2,i},60,'filled','MarkerFaceColor',color(i+3,:)) %在柱状图 x,y 基础上 绘制误差 ,low为下误差,high为上误差,LineStyle 误差图样式,'Color' 误差图颜色 % 'LineWidth', 线宽,'CapSize',误差标注大小 errorbar(i, y(i), low(i), high(i), 'LineStyle', 'none', 'Color', color(i+3,:), 'LineWidth', 1.5,'CapSize',18);end- C/ ]4 V: a2 l. S$ J% R- A
3 坐标和字体的设置
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' `+ R/ R* J* ?6 V, h1 t& H" h坐标和字体的适当配置可以大大增加作图的颜值9 i4 ?" D- c) k m% B& |
%绘制虚线plot([0,3.5],[50,50],'--','Color',color(7,:),'LineWidth',2)ylabel('Time on Warm Floor(%)')ax = gca;%x轴标签ax.XTick = [1 2 3];set(gca,'XTickLabel',{['\color[rgb]{',num2str(color(4,:)) ,'}','Pre-Injection'],['\color[rgb]{',num2str(color(5,:)) ,'}','1 hr CFA'] , ['\color[rgb]{',num2str(color(6,:)) ,'}','1wk CFA']},"LineWidth",2);%y轴标签ax.YTick= 0:20:80;%y轴范围ax.YLim=[0,80];%使得只显示x,y轴两根线box off%坐标轴字体和大小set(gca,"FontName","Times New Roman","FontSize",12,"LineWidth",2)title("TPT Timecourse","FontName","Times New Roman","FontSize",12,"LineWidth",2);+ M0 }0 U# f6 H' Q4 J! j9 ~* D
运行代码,就可以得到这样一张图,还是还原了大部分原图的。+ g- O. y2 A: y& C: r4 Q. y) u
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- s8 G B1 A+ J8 @) J( z3 E$ N ?' K3 A0 E5 m4 z/ ~# ~ Y
两幅图完整源码
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8 ?: s. T2 i; ?1 mclc;color=[0.717647058823529,0.682352941176471,0.741176470588235;... 0.807843137254902,0.792156862745098,0.890196078431373;0.580392156862745,... 0.525490196078431,0.729411764705882;0.392156862745098,0.345098039215686,... 0.470588235294118;0.560784313725490,0.533333333333333,0.741176470588235;... 0.372549019607843,0.282352941176471,0.600000000000000;0.0156862745098039,... 0.0196078431372549,0.0156862745098039];% 颜色1
& ^& e! \0 x6 h5 B& Y7 ~" p9 A6 Sy=[28,34,18];%柱状图纵坐标x=[1,2,3]; %柱状图横坐标%散点图的横纵坐标s1{1,1}=[0.9,0.95,0.95,1,1,1.05,1.1,1.1];s1{1,2}=[1.85,1.9,1.95,2,2,2,2,2.2];s1{1,3}=[2.7,2.7,2.95,3,3,3,3,3,3.2,3.2,3.2];s1{2,1}=[18,24,36,30,42,20,29,38];s1{2,2}=[26,22,24,30,38,42,48,50];s1{2,3}=[9,19,8,12,18,24,30,40,10,17,19];low=[4,3,3]; %误差图的上限high=[3,2,1]; %误差图的下限8 }2 t: k* E4 X& x) Y, R
%%初始化显示位置 [x,y,dx,dy] 从 x,y坐标开始,dx,dy为沿升的长度figure('Units', 'pixels', ... 'Position', [100 100 360 375]);6 E9 m# r' h: S' D6 p, H+ V
width=0.6; %柱状图宽度for i=1:length(y) %bar(i,y(i),width) width 柱状图宽占比 ,FaceColor 柱状图填充颜色 ,EdgeColor 柱状图边缘颜色 % LineWidth 边缘线宽 set(bar(i,y(i),width),'FaceColor',color(i,:),'EdgeColor',color(i+3,:),'LineWidth',2) hold on %散点图 大小,填充颜色 scatter(s1{1,i},s1{2,i},60,'filled','MarkerFaceColor',color(i+3,:)) %在柱状图 x,y 基础上 绘制误差 ,low为下误差,high为上误差,LineStyle 误差图样式,'Color' 误差图颜色 % 'LineWidth', 线宽,'CapSize',误差标注大小 errorbar(i, y(i), low(i), high(i), 'LineStyle', 'none', 'Color', color(i+3,:), 'LineWidth', 1.5,'CapSize',18);end( Y# n/ d2 F4 u) y% f# `
%绘制虚线plot([0,3.5],[50,50],'--','Color',color(7,:),'LineWidth',2)ylabel('Time on Warm Floor(%)')ax = gca;%x轴标签ax.XTick = [1 2 3];set(gca,'XTickLabel',{['\color[rgb]{',num2str(color(4,:)) ,'}','Pre-Injection'],['\color[rgb]{',num2str(color(5,:)) ,'}','1 hr CFA'] , ['\color[rgb]{',num2str(color(6,:)) ,'}','1wk CFA']},"LineWidth",2);%y轴标签ax.YTick= 0:20:80;%y轴范围ax.YLim=[0,80];%使得只显示x,y轴两根线box off%坐标轴字体和大小set(gca,"FontName","Times New Roman","FontSize",12,"LineWidth",2)title("TPT Timecourse","FontName","Times New Roman","FontSize",12,"LineWidth",2);
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& f6 o, q2 z- K/ p3 E" ~4 y: i1 n6 i9 G. B- u) H! e* F( [5 F U6 P
clc;clear;close allcolor=[0.741176470588235,0.729411764705882,0.725490196078431;0.525490196078431,... 0.623529411764706,0.752941176470588;0.631372549019608,0.803921568627451,... 0.835294117647059;0.588235294117647,0.576470588235294,0.576470588235294;... 0.0745098039215686,0.407843137254902,0.607843137254902;0.454901960784314,... 0.737254901960784,0.776470588235294;0.0156862745098039,0.0196078431372549,0.0156862745098039];% 颜色1% C# t* L$ S6 w+ I
%第二个图的y坐标y1=[18,48,38];x=[1,2,3];%第一图的散点图位置{1,}为横坐标,{2,}为纵坐标s2{1,1}=[0.7,0.75,1,1,1,1.05,1.25,1.25];s2{1,2}=[1.85,1.9,1.95,2,2,2.05,2.1,2.2];s2{1,3}=[2.7,2.75,2.95,3,3,3,3,3,3.2,3.2,3.2];s2{2,1}=[8,18,36,18,24,30,17,18];s2{2,2}=[49,51,50,68,52,51,52,50];s2{2,3}=[30,50,20,24,38,40,50,54,58,48,50];low=[4,3,3];high=[3,2,1];figure('Units', 'pixels', ... 'Position', [100 100 360 375]);%初始化显示位置marker={'^','o','s'};width=0.6; %柱状图宽度for i=1:length(y1) set(bar(i,y1(i),width),'FaceColor',color(i,:),'EdgeColor',color(i+3,:),'LineWidth',2) hold on scatter(s2{1,i},s2{2,i},70,'filled',marker{1,i},'MarkerFaceColor',color(i+3,:)) errorbar(i, y1(i), low(i), high(i), 'LineStyle', 'none', 'Color', color(i+3,:), 'LineWidth', 1.5,'CapSize',18);end%绘制虚线plot([0,3.5],[50,50],'--','Color',color(7,:),'LineWidth',2)ylabel('Time on Warm Floor(%)')ax = gca;ax.XTick = [1 2 3];set(gca,'XTickLabel',{['\color[rgb]{',num2str(color(4,:)) ,'}','CFA-con'],['\color[rgb]{',num2str(color(5,:)) ,'}', 'CFA-mon'] , ['\color[rgb]{',num2str(color(6,:)) ,'}',' CFA-Angle']},"LineWidth",2);% ax.XTickLabels ={'CFA-con', 'CFA-mon', ' CFA-Angle'};ax.YTick= 0:20:80;ax.YLim=[0,80];box off%坐标轴字体和大小set(gca,"FontName","Times New Roman","FontSize",12,"LineWidth",2)title({'TPT';'opQ' },"FontName","Times New Roman","FontSize",12,"LineWidth",2);$ C+ L2 S) H: f
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参考资料:/ a* R# l/ B( M. L# [* o
【1】图片来源(sciencemag.org)【10.1126/science.abe3040】: W: j7 Z9 H8 e9 b
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